das könnte ev. an den zugriffsrechten auf das dokument oder den ordner liegen. aber da du den pfad ja weißt, nämlich
Code:
images/stories/Downloads/dein_pdf_file.pdf
(groß-/kleinschreibung beachten) kannst du ihn auch so in die url-zeile des link-popups eintragen. sollte sich das pdf über diesen link nicht öffnen, hast du definitiv ein rechteproblem.
EDIT: der mediamanager ist für alles andere als bilder auch nicht so wirklich zu gebrauchen. ich nutze seit jahren den editor jce, damit kannst du vieles (gerade links) machen, hne immer den media-manager bemühen zu müssen.
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